Fidèle à son mandat de conservation du patrimoine, le musée abrite d'importantes collections d'invertébrés comportant essentiellement des Insectes et des Mollusques.

Les collections entomologiques, constituées au cours des décennies par les très nombreux apports des différents collaborateurs du musée et par l'achat de collections importantes, présentent un large éventail de la faune locale et mondiale. Presque tous les ordres sont présents, mais quelques groupes sont particulièrement bien représentés, en fonction des thèmes de recherche abordés par les scientifiques de l'institution au cours des ans. Car le musée s'est depuis toujours spécialisé en entomologie.

Une partie de la collection de coquillages de A. Prati